Rất nhiều thực phẩm Nhật Bản được chuẩn bị bằng cách sử dụng một hoặc nhiều thứ sau đây:

• Kombu (tảo bẹ), katsuobushi (mảnh cá ngừ vằn được ngâm, đôi khi được gọi là bonito) và niboshi (cá mòi khô) thường được sử dụng để làm nước dùng dashi.
• Negi (hành tây xứ Wales), hành tây, tỏi, nira (hẹ), rakkyō (kiệu) (một loại hành lá).
• Hạt vừng, dầu mè, muối mè (gomashio), furikake, quả óc chó hoặc đậu phộng để cho đẹp.
• Shōyu (nước tương), dashi, mirin, đường, giấm gạo, miso, rượu sake.
• Wasabi (và giả wasabi từ cải ngựa), karashi (mù tạt nóng), ớt đỏ, gừng, tía tô (tía tô hoặc cây bò bít tết) lá, sansho, vỏ cam quýt và rau mùi tây Nhật Bản (gọi là mitsuba).
• Một loại trái cây có tên là cam yuzu cũng là một loại gia vị thường xuyên, được nghiền thành một loại gia vị, được bán dưới dạng yuzukoshō và được trộn với hạt tiêu / ớt và muối. Yuzukoshō được ăn với nhiều món ăn, thêm một hương vị đậm đà vào các món nước dùng / súp như oden, nikujaga, tonjiru, udon cũng như các món ăn khác. Cam Yuzu cũng được nhìn thấy hương vị trà, mứt hoặc zeri (thạch), và bất kỳ số lượng đồ ngọt từ yuzu-an (một loại tương đậu) đến yuzu-hachimitsu (yuzu-mật ong).

Các thành phần ít truyền thống hơn, nhưng được sử dụng rộng rãi bao gồm:

• Mononatri glutamat, thường được các đầu bếp và các công ty thực phẩm sử dụng như một chất tăng hương vị giá rẻ. Nó có thể được sử dụng thay thế cho kombu, một nguồn glutamate miễn phí truyền thống
• Nước sốt Worcestershire theo phong cách Nhật Bản, thường được gọi là "nước sốt" đơn giản, dày hơn và trái cây hơn so với ban đầu, thường được sử dụng làm gia vị cho bàn okonomiyaki (お好み焼き), tonkatsu (トンカツ), croquette ("korokke", コロッケ) và tương tự.
• Mayonnaise Nhật Bản được sử dụng với salad, okonomiyaki (お好み焼き), yaki soba (焼きそば) và đôi khi trộn với wasabi hoặc nước tương.